Styrgruppen sammanträder ca fyra gånger per år för att dra upp riktlinjerna för samarbetet och ta ställning till frågor gällande arbetsfördelning, synergier och samarbetsmöjligheter. Styrgruppen består av allianshögskolornas rektorer (eller prorektor) och tre externa medlemmar. Styrgruppen sammansättning år 2009-2011 är:
Per-Edvin Persson, VD, Heureka (ordf.)
Ulla-Maija Forsberg, prorektor, Helsingfors universitet
Henrik Hägglund, rektor, Svenska social- och kommunalhögskolan vid Helsingfors universitet
Eva Liljeblom, rektor, Hanken Svenska handelshögskolan
Henrik Wolff, rektor, Arcada
Gunborg Gayer, rektor, Helsingfors stads svenska arbetarinstitut
Sekreterare: Helsingforsalliansens koordinator (helsingforsalliansen(at)hanken.fi)