Laskentamalli goes live?

BUGS ei ole ainoa tapaa harjoittaa markov chain monte carlo simulointia, johon bugsin numeerinen laskenta perustuu. R-ohjelmistosta lötyy esimerkiksi paketti rcppbugs, jonka avulla voidaan mcmc simulointi suorittaa pelkästään R-ympäristössä. R on myös sen verran monipuolinen ohjelmointikieli, että simulointi voitaisiin myös koodata sen avulla kokonaan alusta alkaen.

Pelkän R-ohjelmiston käytöstä on tiettyjä etuja. R-ohjelmistoon on saatavilla esimerkiksi shiny-lisäosa, joka mahdollistaa helpon web-appien kehityksen. Kalamallista löytyykin nyt toistaiseksi julkaisematon web-appina toteutettu versio, jonka voi nyt ajaa R-ohjelmiston kautta.

Tämän version laskentatulokset ovat toistaiseksi epäluotettavia ja simuloinnin koodaus saatetaan vielä uudistaa myöhemmin. Web-appi kuitenkin mahdollistaa esimerkiksi helpon priorijakaumien kuvaajien kanssa leikkimisen.

Projektin koodit löytyvät GitHubista ja “Smolt” nimisen appin voi käynnistää R-ohjelmiston kautta seuraavasti:

if(!require(“shiny”)) {
install.packages(“shiny”)
library(shiny)
}

runGitHub(“Smolt”,”hasiOne”)

 

 

Leave a Reply

Your email address will not be published.