ELL Annukka Markkulan tutkimus osoitti Listeria monocytogeneksella olevan kolme tekijää, joilla on merkittävä rooli L. monocytogeneksen kylmänsiedossa. Työssä tutkittiin DEAD-box RNA helikaasien vaikutusta L. monocytogeneksen kylmänsietoon poistamalla tekijöitä koodaavat geenit yksitellen L. monocytogeneksen perimästä. Kolmen mutanttikannan minimikasvulämpötila oli noussut ja kasvu oli hidastunut merkittävästi 3˚C:ssa. Kantojen liikkuvuus oli myös heikentynyt.
Tutkimus tehtiin professori Hannu Korkealan johtamassa tutkimusryhmässä. Tulokset on julkaistu äskettäin arvostetussa Environmental Microbiology -lehdessä.
Environ Microbiol 2012, Early View, doi:10.1111/j.1462-2920.2012.02761.x
Markkula A, Mattila M, Lindström M, and Korkeala H.
Department of Food Hygiene and Environmental Health, University of Helsinki
Genes encoding putative DEAD-box RNA helicases in Listeria monocytogenes EGD-e are needed for growth and motility at 3˚C
Tutkimuksessa todettiin kaikkien neljän L. monocytogenes EGD-e –kannan DEAD-box RNA helikaasia koodaavan geenin ilmentymisen olevan lisääntynyt kylmässä. Mutanttikannoista, joilta yksittäiset helikaaseja koodaavat geenit oli poistettu, kolmen kasvu hidastui L. monocytogenes EGD-e -villikantaan verrattuna kasvulämpötilan laskiessa 37˚C:sta 25˚C:een. 3˚C lämpötilassa näiden kantojen kasvu oli enää hyvin vähäistä. Kantojen minimikasvulämpötilat olivat nousseet villikantaan verrattuna 4,9-8,8˚C:lla.
Kaksi kylmäherkkää helikaasimutanttia ei liikkunut lainkaan liikkuvuuselatusaineella. Kolmannen kylmäherkän mutantin liikkuvuus oli puolta vähäisempää kuin villikannalla. Neljännellä DEAD-box RNA helikaasilla ei ollut merkittävää roolia L. monocytogenes EGD-e -kannan kylmänsiedossa tai liikkuvuudessa.
Tutkimus osoittaa kolmella DEAD-box RNA helikaasilla olevan tärkeä rooli L. monocytogenes EGD-e –kannan kylmänsiedossa ja liikkuvuudessa.
Lähes kaikilla eliölajeilla esiintyvät DEAD-box RNA helikaasit osallistuvat laajasti solujen RNA-aineenvaihduntaan aina RNA-synteesistä sen hajottamiseen. Viimeaikaiset tutkimukset ovat osoittaneet DEAD-box RNA helikaaseilla olevan vaikutusta joidenkin bakteerien kylmäkasvussa. Kylmässä normaalisti yksijuosteinen lähetti-RNA sitoutuu paikoin itseensä ja muodostaa kaksijuosteisia rakenteita. Helikaasit avaavat lyhyitä kaksijuosteisia RNA-ketjuja ja mahdollistavat proteiinien ilmentymisen.
Tutkimuksen on rahoittanut mikrobiologisen elintarviketurvallisuustutkimuksen huippuyksikkö, ABS-tutkijakoulu sekä Walter Ehrströmin säätiö.
Helsingin yliopisto on tilannut koko yliopiston kaikki tieteenalat kattavan tieteellisen arvioinnin joka kuudes vuosi. Elintarvikehygienian ja ympäristöterveyden osaston tutkimusryhmät muodostivat yhdessä eläinlääketieteellisten biotieteiden osaston mikrobiologian tutkimusryhmien kanssa tieteellisen yhteisön (CoE-MiFiSaPLUS), joka rakentuu professori Airi Palvan vetämän huippuyksikön ympärille.