Vaikka antiikin gnostilaiset liikkeet hävisivät taistelun kristinuskon oikean tulkin asemasta, ”gnostilaiset” ajatukset eivät suinkaan kokonaan kadonneet. Jotkin niistä elivät eteenpäin manikealaisuudessa, mandealaisuudessa sekä keskiajan kristillisissä liikkeissä. Näitä olivat esim. 800-luvulla Makedoniassa vaikuttaneet paulikiaanit, 900- 1500 -luvuilla Bulgariassa ja Balkanin niemimaalla toimineet bogomiilit sekä vuosina 1150-1300 Pohjois-Italiassa ja Ranskassa eläneet kataarit. Tämän jälkeenkin eri taiteilijoiden tai tiedemiesten ajattelussa on nähty gnostilaisia vaikutteita. Samoin New Age -liikkeen on ajateltu jatkavan gnostilaisuuden perinteitä.